Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01653 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
P01653 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01653 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P01653 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P01653 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P01653 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P01653 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P01653 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01653 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01653 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01653 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P01653 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P01653 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01653 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01653 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01653 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P01653 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
P01653 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01653 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01653 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01653 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01653 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01653 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01653 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01653 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01653 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01653 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
P01653 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01653 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
P01653 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01653 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01653 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01653 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01653 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01653 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01653 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01653 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01653 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01653 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01653 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01653 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01653 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01653 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01653 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01653 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P01653 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01653 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01653 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01653 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01653 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
P01653 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
P01653 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01653 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01653 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01653 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01653 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01653 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01653 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01653 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01653 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01653 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01653 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01653 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01653 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01653 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01653 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01653 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01653 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01653 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01653 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
P01653 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01653 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01653 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01653 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01653 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01653 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01653 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01653 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01653 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P01653 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01653 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01653 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
P01653 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01653 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01653 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01653 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01653 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01653 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01653 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01653 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01653 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01653 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01653 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 841.5 ms