Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ier5O89113 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ier5O89113 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ier5O89113 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ier5O89113 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ier5O89113 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ier5O89113 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ier5O89113 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ier5O89113 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ier5O89113 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ier5O89113 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ier5O89113 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ier5O89113 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ier5O89113 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ier5O89113 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ier5O89113 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ier5O89113 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ier5O89113 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ier5O89113 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ier5O89113 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ier5O89113 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ier5O89113 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ier5O89113 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ier5O89113 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ier5O89113 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ier5O89113 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ier5O89113 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ier5O89113 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ier5O89113 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ier5O89113 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms