Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Socs5O54928 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Socs5O54928 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Socs5O54928 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Socs5O54928 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Socs5O54928 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Socs5O54928 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Socs5O54928 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Socs5O54928 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Socs5O54928 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Socs5O54928 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Socs5O54928 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Socs5O54928 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Socs5O54928 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Socs5O54928 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Socs5O54928 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Socs5O54928 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Socs5O54928 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Socs5O54928 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs5O54928 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Socs5O54928 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Socs5O54928 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms