Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DffaO54786 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DffaO54786 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DffaO54786 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DffaO54786 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DffaO54786 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DffaO54786 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DffaO54786 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DffaO54786 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DffaO54786 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DffaO54786 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DffaO54786 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DffaO54786 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DffaO54786 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DffaO54786 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DffaO54786 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DffaO54786 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DffaO54786 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DffaO54786 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DffaO54786 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DffaO54786 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DffaO54786 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DffaO54786 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DffaO54786 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DffaO54786 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DffaO54786 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DffaO54786 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DffaO54786 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DffaO54786 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DffaO54786 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DffaO54786 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DffaO54786 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DffaO54786 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DffaO54786 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DffaO54786 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DffaO54786 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DffaO54786 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DffaO54786 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DffaO54786 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DffaO54786 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DffaO54786 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DffaO54786 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DffaO54786 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DffaO54786 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DffaO54786 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DffaO54786 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DffaO54786 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DffaO54786 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DffaO54786 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DffaO54786 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DffaO54786 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DffaO54786 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DffaO54786 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DffaO54786 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DffaO54786 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DffaO54786 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DffaO54786 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DffaO54786 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DffaO54786 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DffaO54786 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DffaO54786 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DffaO54786 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DffaO54786 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DffaO54786 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DffaO54786 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DffaO54786 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DffaO54786 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DffaO54786 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DffaO54786 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DffaO54786 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DffaO54786 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DffaO54786 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DffaO54786 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DffaO54786 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DffaO54786 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DffaO54786 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DffaO54786 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DffaO54786 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DffaO54786 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DffaO54786 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DffaO54786 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DffaO54786 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DffaO54786 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DffaO54786 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DffaO54786 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms