Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edil3O35474 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Edil3O35474 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Edil3O35474 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edil3O35474 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edil3O35474 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edil3O35474 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edil3O35474 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Edil3O35474 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Edil3O35474 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Edil3O35474 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edil3O35474 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edil3O35474 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Edil3O35474 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edil3O35474 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edil3O35474 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Edil3O35474 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Edil3O35474 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edil3O35474 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edil3O35474 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edil3O35474 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Edil3O35474 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Edil3O35474 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edil3O35474 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms