Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
WrnO09053 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
WrnO09053 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
WrnO09053 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
WrnO09053 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
WrnO09053 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
WrnO09053 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
WrnO09053 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
WrnO09053 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
WrnO09053 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
WrnO09053 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
WrnO09053 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
WrnO09053 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
WrnO09053 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
WrnO09053 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
WrnO09053 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
WrnO09053 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
WrnO09053 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
WrnO09053 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
WrnO09053 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
WrnO09053 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
WrnO09053 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
WrnO09053 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
WrnO09053 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
WrnO09053 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
WrnO09053 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
WrnO09053 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
WrnO09053 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
WrnO09053 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
WrnO09053 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
WrnO09053 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
WrnO09053 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
WrnO09053 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
WrnO09053 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
WrnO09053 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
WrnO09053 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
WrnO09053 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
WrnO09053 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
WrnO09053 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
WrnO09053 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
WrnO09053 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WrnO09053 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WrnO09053 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WrnO09053 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
WrnO09053 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
WrnO09053 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
WrnO09053 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
WrnO09053 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
WrnO09053 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
WrnO09053 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
WrnO09053 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
WrnO09053 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
WrnO09053 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
WrnO09053 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
WrnO09053 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
WrnO09053 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
WrnO09053 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
WrnO09053 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
WrnO09053 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
WrnO09053 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
WrnO09053 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
WrnO09053 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
WrnO09053 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
WrnO09053 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
WrnO09053 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
WrnO09053 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WrnO09053 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
WrnO09053 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
WrnO09053 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
WrnO09053 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
WrnO09053 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
WrnO09053 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
WrnO09053 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
WrnO09053 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
WrnO09053 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
WrnO09053 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
WrnO09053 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
WrnO09053 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
WrnO09053 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
WrnO09053 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
WrnO09053 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WrnO09053 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WrnO09053 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
WrnO09053 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
WrnO09053 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
WrnO09053 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
WrnO09053 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
WrnO09053 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WrnO09053 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WrnO09053 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
WrnO09053 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WrnO09053 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WrnO09053 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
WrnO09053 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
WrnO09053 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
WrnO09053 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
WrnO09053 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
WrnO09053 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
WrnO09053 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
WrnO09053 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms