Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyth3O08967 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyth3O08967 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyth3O08967 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyth3O08967 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyth3O08967 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyth3O08967 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth3O08967 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth3O08967 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyth3O08967 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyth3O08967 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms