Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3542K7N6U2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3542K7N6U2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3542K7N6U2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3542K7N6U2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3542K7N6U2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3542K7N6U2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3542K7N6U2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms