Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccer2J3QPU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccer2J3QPU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccer2J3QPU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccer2J3QPU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccer2J3QPU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccer2J3QPU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccer2J3QPU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccer2J3QPU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccer2J3QPU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccer2J3QPU5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccer2J3QPU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccer2J3QPU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccer2J3QPU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccer2J3QPU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccer2J3QPU5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms