Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3415J3QMS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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