Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm11236J3QMS7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm11236J3QMS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm11236J3QMS7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm11236J3QMS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm11236J3QMS7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm11236J3QMS7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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