Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17lcG5E8I7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17lcG5E8I7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp17lcG5E8I7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp17lcG5E8I7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17lcG5E8I7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Usp17lcG5E8I7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms