Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp17ldG5E8G2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp17ldG5E8G2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp17ldG5E8G2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp17ldG5E8G2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp17ldG5E8G2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Usp17ldG5E8G2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms