Protein–RNA interactions for Protein: G3UXR8

Gm20532, Predicted gene 20532, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20532G3UXR8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20532G3UXR8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20532G3UXR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20532G3UXR8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20532G3UXR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20532G3UXR8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20532G3UXR8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20532G3UXR8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20532G3UXR8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20532G3UXR8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20532G3UXR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20532G3UXR8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20532G3UXR8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20532G3UXR8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms