Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r85G3UW56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r85G3UW56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r85G3UW56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r85G3UW56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn2r85G3UW56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r85G3UW56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r85G3UW56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r85G3UW56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r85G3UW56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r85G3UW56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r85G3UW56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms