Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pira2F8VQ94 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pira2F8VQ94 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pira2F8VQ94 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pira2F8VQ94 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pira2F8VQ94 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pira2F8VQ94 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms