Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3072F6SKY8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3072F6SKY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3072F6SKY8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3072F6SKY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms