Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnah11E9Q7N9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnah11E9Q7N9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnah11E9Q7N9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnah11E9Q7N9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.2 ms