Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DspE9Q557 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DspE9Q557 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DspE9Q557 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DspE9Q557 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DspE9Q557 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DspE9Q557 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DspE9Q557 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DspE9Q557 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DspE9Q557 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DspE9Q557 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DspE9Q557 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DspE9Q557 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DspE9Q557 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DspE9Q557 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DspE9Q557 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
DspE9Q557 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DspE9Q557 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms