Protein–RNA interactions for Protein: E9PZV8

1810032O08Rik, RIKEN cDNA 1810032O08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810032O08RikE9PZV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1810032O08RikE9PZV8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1810032O08RikE9PZV8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
1810032O08RikE9PZV8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
1810032O08RikE9PZV8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms