Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptrhd1D3Z4S3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptrhd1D3Z4S3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptrhd1D3Z4S3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptrhd1D3Z4S3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptrhd1D3Z4S3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptrhd1D3Z4S3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms