Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc8D3YZV8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc8D3YZV8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc8D3YZV8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc8D3YZV8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc8D3YZV8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc8D3YZV8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms