Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccnyl1D3YUJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccnyl1D3YUJ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccnyl1D3YUJ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccnyl1D3YUJ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccnyl1D3YUJ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccnyl1D3YUJ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms