Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phf11bB4XVQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf11bB4XVQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf11bB4XVQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf11bB4XVQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf11bB4XVQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf11bB4XVQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf11bB4XVQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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