Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap58B2RW38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cfap58B2RW38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfap58B2RW38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfap58B2RW38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cfap58B2RW38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms