Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
1700018F24RikB2RW27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
1700018F24RikB2RW27 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
1700018F24RikB2RW27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
1700018F24RikB2RW27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
1700018F24RikB2RW27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
1700018F24RikB2RW27 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1700018F24RikB2RW27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms