Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
Abcc8B2RUS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
Abcc8B2RUS7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.72■■■■■ 5.55
Abcc8B2RUS7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
Abcc8B2RUS7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
Abcc8B2RUS7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
Abcc8B2RUS7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
Abcc8B2RUS7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
Abcc8B2RUS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC49.66■■■■■ 5.54
Abcc8B2RUS7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
Abcc8B2RUS7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
Abcc8B2RUS7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
Abcc8B2RUS7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC49.59■■■■■ 5.53
Abcc8B2RUS7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC49.58■■■■■ 5.53
Abcc8B2RUS7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
Abcc8B2RUS7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
Abcc8B2RUS7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC49.48■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Abcc8B2RUS7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC49.44■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
Abcc8B2RUS7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.37■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC49.36■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
Abcc8B2RUS7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
Abcc8B2RUS7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
Abcc8B2RUS7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
Abcc8B2RUS7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC49.26■■■■■ 5.48
Abcc8B2RUS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
Abcc8B2RUS7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.48
Abcc8B2RUS7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC49.25■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC49.25■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC49.21■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
Abcc8B2RUS7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC49.15■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
Abcc8B2RUS7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC49.07■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.07■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC49.07■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC49.07■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Abcc8B2RUS7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
Abcc8B2RUS7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
Abcc8B2RUS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms