Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp42B2RQC2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp42B2RQC2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Usp42B2RQC2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp42B2RQC2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp42B2RQC2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp42B2RQC2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp42B2RQC2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms