Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nipsnap3aB1AWZ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nipsnap3aB1AWZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nipsnap3aB1AWZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms