Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm438B1ASB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm438B1ASB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm438B1ASB3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm438B1ASB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm438B1ASB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm438B1ASB3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms