Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Skint2A7XUX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Skint2A7XUX6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Skint2A7XUX6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Skint2A7XUX6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms