Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS4

Gm10406, Alpha7-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10406A6NAS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10406A6NAS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10406A6NAS4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10406A6NAS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10406A6NAS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10406A6NAS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms