Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc9bA3KGF9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc9bA3KGF9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc9bA3KGF9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc9bA3KGF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc9bA3KGF9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms