Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5640A3KG49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm5640A3KG49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5640A3KG49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm5640A3KG49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms