Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1jA2BFR3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1jA2BFR3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2al1jA2BFR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2al1jA2BFR3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al1jA2BFR3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms