Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn3A2ALK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn3A2ALK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptpn3A2ALK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn3A2ALK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn3A2ALK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn3A2ALK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn3A2ALK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpn3A2ALK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn3A2ALK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms