Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kiaa1109A2AAE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kiaa1109A2AAE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kiaa1109A2AAE1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kiaa1109A2AAE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms