Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fam71e1A1L3C1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fam71e1A1L3C1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Fam71e1A1L3C1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fam71e1A1L3C1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fam71e1A1L3C1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms