Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
0610012G03RikA0A0J9YTR2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms