Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BC034090A0A087WP46 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BC034090A0A087WP46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BC034090A0A087WP46 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC034090A0A087WP46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BC034090A0A087WP46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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