Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tor1aQ9ER39 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms