Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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