Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arcn1Q5XJY5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms