Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms