Protein–RNA interactions for Protein: P09793

Ctla4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla4P09793 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctla4P09793 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms