Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbip1J3QMK2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms