Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms