Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Edf1Q9JMG1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Edf1Q9JMG1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms