Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hmgn5Q9JL35 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hmgn5Q9JL35 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms