Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BPC6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms